飞鱼王子手游继承了超级玛丽的经典玩法，加入了丰富的射击武器系统，使用武器和道具帮助自己过关， 游戏中共有五大风格迥异的场景，只有通关上一场景后才能开启下一场景，每个场景内出现的怪物各有不同。如在某一场景内中途退出游戏或游戏失败，只能从当前场景从头开始游戏。不同的地图关卡需要玩家合理的做出应对，还能收集宝藏获得额外道具。