Cytoscape MAC版是一款十分出色的开源网络软件，Cytoscape
MAC最新版旨在帮助您可视化分子相互作用网络和生物路径，以及将网络与基因表达谱、注释和相关凝视数据集成在一起，Cytoscape
MAC版还支持多种分析方式，可以选择分析网络。
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软件介绍
Cytoscape Mac版最初是为生物学研究而创建的，后来扩展了其应用范围，成为复杂网络分析和可视化的通用平台。Cytoscape核心分布具有一组基本特性，专门用于数据分析、集成和可视化。您还可以使用以前称为插件的应用程序扩展该特性集，这些插件可用于网络和分子分析、新布局、扩展文件格式支持、脚本编写和与数据库的连接。
功能介绍
公共数据库客户端
Cytoscape是作为一个网络服务客户端工作的，这意味着Cytoscape可以直接连接外部公共数据库，导入网络和注释数据。这意味着Cytoscape可以直接连接到外部公共数据库，并导入网络和注释数据。目前，我们支持Pathway Commons, IntAct, BioMart和NCBI Entrez Gene。我们还将继续为热门数据库开发新的服务客户端。
互操作性
由于Cytoscape支持导入/导出标准文件格式，你可以很容易地将Cytoscape放入你的工作流程中。例如，如果你有一个由 igraph 或 Bioconductor 生成的网络数据，Cytoscape 可以将该文件以文本表的形式加载，并以 PSI-MI 格式导出，供其他生物信息学工具或你自己的应用程序/脚本使用。
从 3.3 版本开始，Cytoscape 支持 RESTful API 的编程访问。你可以使用你选择的编程语言来访问Cytoscape的核心功能，如创建网络，应用布局，或图像导出。
会话文件
你可以通过一键保存你的工作。所有的设置、数据文件和可视化都打包在一个会话文件中。它被称为Cytoscape会话(.cys)文件。Cytoscape 会话文件包括网络、属性(节点/边缘/网络)、桌面状态(选择/隐藏节点和边缘、窗口大小)、属性、一些插件状态和可视化风格。
布局
在二维空间布局网络。 有多种布局算法可供选择，包括循环、树形、力导向、边缘加权和yFiles有机布局。您也可以使用类似于其他图形应用程序用户界面的手动布局工具。
软件特色
1、支持多种分析方式，可以选择分析网络。
2、支持分析节点的子集、批次分析、加载网络统计信息
3、绘制参数、从统计信息生成样式
4、使用可扩展对话框界面显示网络统计信息
5、在节点表中存储节点参数、在边缘表中存储边缘参数
6、明亮的颜色映射标准 ameters、暗色映射标准 ameters、中间颜色映射标准 ameters
7、NetworkAnalyzer、Cytoscape 网络浏览器
8、合并流程、作业状态监视器、命令行对话框、执行命令文件
9、选定的节点、带有选项的选定节点、命令行参数
10、Cytoscape 的快速游览、创建网络、嵌套网络
11、支持的网络文件格式、节点和边列数据
12、风格、应用程序管理器、命令工具、渲染引擎、导出数据
13、Cytoscape 和 OpenCL、Cytoscape.js 和Cytoscape 自动化
